Как и полагается для такого музея, Музей археологии Москвы находится глубоко под землей. Он расположен на Охотном ряду в самом центре Москвы и на глубине 7 метров. В городах культурный слой образуется со скоростью 1 метр в 100 лет, поэтому в музее представлены экспонаты которым ну очень много лет. Музей возник после строительства торгового центра «Охотный ряд» в 2007 году. При строительстве нашли очень много разных артефактов (вещей) и кладов с монетами.
А ещё раньше на этом месте была река Неглинка и через неё стоял каменный мост, который вел к воротам Московского Кремля на Красную Площадь. Потом реку закопали в трубу, а мост засыпали грунтом. Фундамент и опоры этого моста сейчас можно наблюдать в этом музее.